Leica LAS X 3D Analyse

LAS X 3D Analyse
Das LAS X 3D Analysepaket bietet interaktive Messungen, Analyseassistent, Classifier und Bildverarbeitungs-Werkzeuge. Zum Messen verschiedener Aspekte dreidimensionaler Strukturen wie Zellkernvolumen, Oberfläche oder Entfernungen und Winkel zwischen den Zellkernen. Individuelle 3D-Objekte können mit dem interaktiven 3D-Messwerkzeug gemessen werden. Zur automatischen Messung führt ein Hilfsprogramm Schritt für Schritt durch die 3D-Analyse, von der Bildvorbereitung über Anpassung der Grenzwerte, Erzeugen einer 3D Binärmaske, Auswahl von Messparametern bis zum Erstellen von Berichten. Im Image Viewer bekommt man sofort Rückmeldung zu den vorgenommenen Einstellungen. Serien mit mehreren Aufnahmekanälen können in einem Workflow bearbeitet werden, indem die unterschiedlichen Fluoreszenzsignale verschiedenen Analysekanälen zugeordnet werden. Die Ergebnisse der einzelnen Analysekanäle können miteinander in Verbindung gebracht werden, so dass Objekte aus einem Kanal als Referenz für andere Kanäle dienen können. Der Analyseworkflow kann als benutzerdefiniertes Protokoll abgespeichert und so auf weitere Datensätze angewendet werden. Zur Dokumentation oder nachgelagerten Analyse können die Ergebnisse mit den Experimentdaten abgespeichert oder als Excel-Report, zusammen mit Histogrammen und Bildern von Zwischenschritten, exportiert werden. Zur statistischen Auswertung können die Daten mehrerer Experimente mit Hilfe einer Batch Liste analysiert werden. Das 3D Analysepaket kann auch zur 2D Analyse von 2D Datensätzen verwendet werden. Das 3D Analysepaket enthält:
Assistenzprogramm zur automatischen 3D-Analyse von mehreren Aufnahmekanälen. Der 3D Analyseassistent bietet eine große Auswahl an Filtern, Segmentation mit optionaler, automatischer Schwellenfestlegung, binäre Filter, manuelle Kombination bzw. Separation von Objekten. Bestimmung von Volumen, Oberfläche, Durchmesser, viele Form- und Intensitätsparameter, Positionsbestimmung und Statistiken für alle unterstützten Funktionen. Classifier
Das Klassifizierungsmodul liefert objektive und reproduzierbare Klassifizierungssergebnisse, sogar in Situationen in denen Grenzwerte oder Filter nicht anwendbar sind. Der Classifier basiert auf einer Support Vector Machine. Zunächst werden mit Hilfe eines Trainingsdatensatzes Objekte vordefinierten Klassen zugeordnet ("Supervised Learning"). Hiermit wird der Classifier trainiert, indem numerische Eigenschaften verschiedener Bildmerkmale analysiert werden. Der Classifier kann jetzt auf weitere Datensätzen angewendet werden, um unbekannte Objekte diesen vordefinierten Klassen zuzuordnen. Interaktive 3D-Messungen
Interaktive Messung von Volumen, Oberfläche, Entfernung, Länge ,Gesamtlänge einer Reihe von Linien, Freihand-Kurven, Winkel,Objektzä hlung. Verarbeitungs-Werkzeuge
Verarbeitungswerkzeuge können in beliebiger Reihenfolge zur Ermittlungdes 3D-Volumens angewandt werden. Sie beinhalten Glättungs- undmorphologische Filter, Segmentierungswerkzeuge, Erzeugen von Binärmaskenund einen leistungsstarken Bildrechner. 3D Bildrechner
Der 3D Bildrechner, der komplexe Bildanalyseformeln verarbeiten kann, ist das Herzstück der Verarbeitungswerkzeuge. Enthalten sind u.A. arithmetische Operationen sowie Boole-Funktionen. Zur Verwendung der 3D Analyse werden die 3D Visualization-Module Basic und Advanced benötigt